استحدثت جامعة الشرق الأوسط 6 تخصصات أكاديمية، 4 منها لبرنامج البكالوريوس، هي: التحاليل الطبية والعلوم المخبرية، التغذية والصحة التكاملية، الإدارة والتدريب الرياضي، وإدارة الموارد البشرية، وواحد لبرنامج الماجستير هو: اللغة العربية وآدابها، وواحد لبرنامج الدبلوم المتوسط هو: السينما وصناعة الأفلام.
هذه التخصصات تعكس نهجًا تقدميًا للجامعة، يرتكز على فهم عميق لاتجاهات سوق العمل المعاصرة، وتفضيلاته، فضلًا عن الالتزام بتزويد الطلبة بتعليم شامل، وحيوي، يدفع قدراتهم، ويثري معارفهم، وهو ما جاء نتيجة مباحثات، ولقاءات دورية مع أصحاب الاختصاص وأرباب العمل.
وعن تخصصات البكالوريوس، فإن تخصص التحاليل الطبية والعلوم المخبرية سيتيح للطلبة التفاعل مع تقنيات التشخيص، وتكنولوجيا المختبرات، وتحليل البيانات، مما يعدهم للعب دور حاسم ومؤثر في اكتشاف الأمراض، والبحث الطبي، والصحة العامة، فيما يدمج تخصص التغذية الصحية المتكاملة، المبادئ العلمية مع التطبيقات البحثية، ما يمكن الطلبة من تطوير خطط التغذية الديناميكية.
أما تخصص الإدارة والتدريب الرياضي، فإنه يغطي مجالات عدة منها: إدارة الأحداث، وعلم النفس الرياضي، ويُكسب الطلبة فهمًا عميقًا لمنهجيات التدريب التي تعزز الأداء الرياضي، ليتعمق تخصص إدارة الموارد البشرية في الاستراتيجيات والممارسات التي تدفع إدارة القوى العاملة الفعالة.
بالانتقال لبرنامج ماجستير اللغة العربية وآدابها، فإنه يكرس نفسه للحفاظ على التراث الثقافي الغني للغة العربية، فمن خلاله، وسيغذي الطلبة بفهمٍ أعمق للهوية العربية ومساهماتها في الثقافة العالمية.
ويأتي برنامج الدبلوم المتوسط في السينما وصناعة الأفلام مع إدراك التأثير المتزايد لوسائل الإعلام المرئية في تشكيل الخطاب العام والثقافة، كما أنه يقدم تعليمًا شاملًا سيشكل إنتاج سرديات بصرية مقنعة تلقى صدى لدى جماهير متنوعة.
تجدر الإشارة إلى أن عدد كليات الجامعة هو 10، وتضم 46 برنامج توزع كما يلي: 32 برنامج بكالوريوس، وبرنامج دبلوم عالي، و12 برنامج ماجستير، وبرنامج دبلوم متوسط.